Маргарита Николова завършва Технически университет - София, магистър по компютърни системи и управление, и УНСС, магистър по счетоводство и контрол. Има следдипломни квалификации по специалностите "Финансово счетоводство и правна дейност на фирмата" и "Международни счетоводни стандарти".

От 1989 до 2001 г. е главен счетоводител в БСФС Български спортни федерации и "Национален музикален център" АД. Член на Съвета на директорите на Национална спортна база (2002 - 2005) и член на ревизионната комисия към Международната федерация "Вдигане на тежести" (2005 - 2009).

От 2001 до 2010 г. е финансов директор на Държавната агенция по младежта и спорта (2001 - 2002), Министерството на младежта и спорта (2002 - 2005), Изпълнителна агенция по рибарство и аквакултури (2006 - 2007), Министерството на труда и социалната политика (2007 - 2009) и Министерството на регионалното развитие и благоустройството (2009 - 2010).

На 1 декември 2010 г. става финансов директор на Българската национална телевизия. На 7 април 2011 г. е избрана от XLI народно събрание за член на Консултативния съвет на Сметната палата.