Завършва в Юридическия факултет на Софийския университет "Св. Климент Охридски" през 1971 година. Защитава дисертация за кандидат на юридическите науки през 1979 година. Специализира във Виенския университет през 1983 година, както и в Института по чуждестранно и международно частно право "Макс Планк" в Хамбург, Германия. От 1979 година Герджиков е старши асистент при проф. Витали Таджер, от 1989 година е доцент, а от 1995 година - професор по гражданско и търговско право в Софийския университет "Св. Климент Охридски". В периода 1991-1993 година е заместник-декан на Юридическия факултет. Автор на монографии и десетки статии в областта на търговското право. През 1993-1994 г. е заместник-ректор на Софийския университет.

Изнася лекции и доклади в Ягелонския университет в Краков, Европа Институт в Саарбрюкен, Женевския университет, Института "Макс Планк" и Търговската палата в Хамбург.

На 5 юли 2001 г. е избран за председател на 39-то Народно събрание. На 4 февруари 2005 г. със 119 депутати гласуват "за", 114 "против" и 1 "въздържал се" Огнян Герджиков е отстранен предсрочно от поста Председател на Народното събрание. Причината която изтъкнали за уволнението е "системно превишаване на правата и неизпълнение на задълженията му в рамките на неговата компетентност".

Избиран е два пъти за народен представител от листата на НДСВ. Председател на Парламентарната комисия по правата на човека и вероизповеданията в 40-ото Народно събрание.

Научните му интереси са в областта на гражданското, търговското и дружествено право и арбитража. Владее немски и руски език.

Съпруга на Огнян Герджиков е Светла Герджикова. Двамата сключват граждански брак през 1972 г.