Методи Андонов завършва ВИТИЗ "Кръстьо Сарафов" в София със специалност театрална режисура през 1955 г.
Започва работа в Бургаския драматичен театър, а от 1959 г. - в Сатиричния театър в София, където са най-големите му успехи, сред които постановки на "Суматоха" на Йордан Радичков, "Предложение. Сватба. Юбилей" на Антон Чехов, "Чичовци" на Иван Вазов, "Михаил Мишкоед" на Сава Доброплодни, "Смъртта на Тарелкин" на Александър Сухово-Кобилин, "Ревизор" на Николай Гогол.

През 1968 г. заснема първия си филм.

През 1970 г. напуска Сатиричния театър и започва да се занимава главно с кино.

През 1972 г. заснема "Козият рог", по разказа на Николай Хайтов.

Умира на 12 април 1974 г. в София.