Борис Марков е икономист със специалност "Стопанско управление", Марков е специализирал "Управление и анализ на финансови потоци" и "Проджект мениджмънт" във Франция. В професионален план е бил управляващ съдружник в компания за стратегическо планиране и анализи.

В СДС Марков членува от 2001 г. В периода 2008-2009 г. е началник на кабинета на председателя на партията, а през 2009 г. участва в Националния щаб на СДС като финансист на кампаниите за Европейски парламент и за 41-вото Народно събрание.

На 5 юни 2012 г. Националният съвет на Съюза на демократичните сили избра Борис Марков за временен председател на партията в един от най-трудните периоди за формацията.