Иван Шишков завършва образователна степен магистър по архитектура през 1990 г. във Висшия институт по архитектура и строителство в София.

Работил е като проектант в "Интерпроект" и "Софпроект".

В периода между 1992 и 2000 г. е главен архитект на община Драгоман, от 2002 до 2008 г. е главен архитект на район "Банкя" в Столичната община, а от 2008 до 2021 г. - на район "Триадица".

Между 1996 и 2006 г. e член на Общинския експертен съвет по устройство на територията, а от 2007 до 2015 г. е експерт в Комисията по устройство на територията и жилищна политика към СОС.

По време на двете служебни правителства, назначени от президента Румен Радев през 2021 г., е съветник и заместник-министър в Министерството на регионалното развитие и благоустройството.

От 2 август 2022 г. е служебен министър на регионалното развитие и благоустройството в правителството на Гълъб Донев.