Кръстю Сарафов учи в Сяр, Солун и накрая завършва Първа мъжка гимназия в София. Родителите на Кръстьо Сарафов били твърдо против той да стане артист и го изпращат да учи в Одрин, за да го откъснат от любовта му към театъра.

През 1893 г. завършва Одринската българска мъжка гимназия и се връща в България. През 1895 г. се явява на конкурс за стипендии по драматично изкуство в чужбина. Приемат само 4 от 60 души и Кръстьо Сарафов е сред тях.

Дебютира в ролята на Спиро Македонски ("Стефан Караджа" - Т. Хаджистанчев) в театър "Зора" на Б. Пожаров (1891).

Заминава за Санкт Петербург и там се записва в частна драматична школа. Разочарован от системата на преподаване, през 1895 г. Сарафов се мести в Императорското театрално училище при Александър Ленски и Владимир Давидов където завършва с отличен успех през 1899 г. и се връща в България.

През 1901 г. сключва брак с актрисата Донка Гюзелева, дъщеря на просветния деец Иван Гюзелев.

Дебютира в софийската театрална трупа "Сълза и смях" на 3 октомври 1899 г. и играе там до 1904 г., след това в Народния театър с кратки прекъсвания до 1952 г., където е актьор и главен режисьор (1915-1919).

През 1905 г. заедно с Атанас Кирчев, Христо Ганчев, Адриана Будевска, Стоян Бъчваров и други основава пътуващия "Свободен театър". Основател и пръв директор на оперетния театър "Ренесанс" в София (1919), актьор и режисьор в Русенския градски театър (1922-1925), директор на Бургаския театър (1932-1934), актьор във Варненския общински театър (1935-1936), Пловдивския народен театър (1937-1938). Гастролира в Белградския народен театър (1936-1937), участва в турнето на част от трупата в САЩ и Канада (1937).

Председател е на Съюза на драматическите и оперни артисти в 1924 - 1925 г.