Прави дебют в А група през 2005 г. с екипа на Пирин 1922 с които изиграва 30 срещи и отбелязва 1 гол. С обединеният Пирин (Благоевград) записва още 20 срещи, както и финал за Купата на България.

На 5 юли 2009 г. подписва 5-годишен договор с отбора на Литекс Ловеч.

На 1 август 2014 година преминава в английския Фулъм, като подписва договор за 3+1 години за трансферната сума от 1 милион евро.

На 23 януари 2017 годнина, Бодуров подписва с ЦСКА (София) до края на сезона. Дебютира за ЦСКА (София) на 18 февруари 2017 г.