Стефан Янев завършва Висшето народно военно-артилерийско училище "Георги Димитров" в гр. Шумен през 1983 г.

През 1993 г. завършва Военната академия в София и Военен колеж към Националния военен университет във Вашингтон, САЩ (2005 г.).

Бил е командир на артилерийски взвод и батарея (1983 г.), командир на дивизион в Асеновград (1993 г.).

Работил е като офицер за анализ към Департамента по планиране и програмиране на Групата за координиране на ПЗМ в Белгия и началник на департамент "Tрансформации" в Центъра на НАTО за борба c тероризма.

В периода 2007-2010 г. е последователно директор на дирекция "Отбранителна политика" към Министерството на отбраната, директор на дирекция "Политика за сигурност и отбрана" и директор на дирекция "Отбранителна политика".

В периода 2011-2014 г. е военен аташе в САЩ.

Между май 2014 и 19 юни 2014 е началник на Националния военен университет.

От 27 януари до 4 май 2017 г. е заместник министър-председател и министър на отбраната на Република България в служебното правителство на Огнян Герджиков, а впоследствие е съветник на Президента.

През 2021 г. е избран за служебен министър-председател.