Борислав Сарафов завършва 27 ЕСПУ "Акад. Георги Караславов" в София през 1987 г., а през 1994 г. завършва специалност "Право" и "Охрана на обществения ред и престъпността" във Висшия институт на МВР.

След това става инспектор по режимно-административната дейност в Главно управление на местата за лишаване от свобода. Остава на тази позиция до 26 януари 1996 г., когато става следовател в Софийската окръжна следствена служба. От 2001 г. е заместник-районен прокурор в Районната прокуратура в Сливница.

В периода 2001-2006 г. е прокурор в Софийска окръжна прокуратура. След това до 28 февруари 2007 г. е прокурор във Върховна административна прокуратура отдел "Съдебен". Между 1 март 2007 г. и 29 юни 2011 г. е прокурор във Върховна касационна прокуратура отдел "Противодействие на организираната престъпност". През 2011 г. става ръководител на Апелативната специализирана прокуратура. От 18 януари 2013 г. е заместник на главния прокурор на Република България, а от 18 декември 2017 г. директор на Националната следствена служба.

На 26 септември 2022 г. кандидатурата на Сарафов за втори мандат бе предложена от главния прокурор Иван Гешев и трима членове на Прокурорската колегия - Светлана Бошнакова, Огнян Дамянов и Йордан Стоев. През ноември 2022 г. е преизбран за втори мандат за директор на Националната следствена служба.